В двух словах, когда раздел монтируется - создается кернел-тред jbd2/sdc5. Который, после размонтирования раздела - не умирает.
Из-за чего, fsck не хочет проверять диск. А надо.

root@kir2yar:/# mount | grep /dev/sdc
/dev/sdc1 on / type ext4 (rw,errors=remount-ro)
/dev/sdc4 on /tmp type ext4 (rw)
/dev/sdc2 on /var type ext4 (rw)

root@kir2yar:/# fsck -rccfp /dev/sdc5
fsck из util-linux 2.20.1
/dev/sdc5 is in use.
e2fsck: Cannot continue, aborting.

root@kir2yar:/# lsof | grep sdc5
Output information may be incomplete.
jbd2/sdc5 881 root cwd DIR 8,33 4096 2 /
jbd2/sdc5 881 root rtd DIR 8,33 4096 2 /
jbd2/sdc5 881 root txt unknown /proc/881/exe

Разумеется kill -9 881 не работает, поскольку это ядерный тред.

И что делать - уже тупо не знаю. Гугл не помог. :( Те, подсказал решение с перезапуском, но оно очевидное-же. А я без перезапуска хочу.

Если бы корень был не на этом винте - просто отрубил-бы винт нафиг. Увы, корень тут.