После выполнения простой команды
convert source.pdf output.pdf
изображение output.pdf меняет структуру CMYK. В source.pdf черный канал был в одном цвете, а в output.pdf - в нескольких цветах.
в Photoshop это продемострировать можно так:
source.pdf. Если отключить черный канал, то весь черный цвет на изображении пропадает. http://joxi.ru/vAWl4ajcOJ5kdr
output.pdf. А здесь, если отключить черный канал, весь текст остается в других цветах. http://joxi.ru/KAgYk4jFKpyE6m
P.S. Не обращайте внимания на разрешения изображения output.pdf. Это к теме не относится.
Буду благодарен за помощь!