Посоветуйте программу для быстрого рисования графов.

он удобен для машинного вывода

Так и надо машинно выводить.

но ручками графы строить, подбирая в нём нужные углы рёбер и размеры вершин,

Он вроде как сам это делает. Там же с десяток методов, а ты небось один попробовал?

чтобы правильно в страницу влезал - это мучение.

«вписать в страницу» при печати.

Он вроде как сам это делает.

Вот в этом-то и беда.

Вот в этом-то и беда.

Там разные методы есть же. Я тоже сначала dot попробовал и ужаснулся. Но т.к. рисовать самому было лень прочитал таки документацию. Для трёхуровневого графа с ~60 узлами идеально подошел fdp. И это безо всяких настроек (т.е. тупо список нод и связей).

Ну а если не лень самому - выводи в svg и правь любым редактором (inkscape, dia). Но по своему опыту скажу - пять минут чтения документации ничто против часа ковыряния мышкой. Dia ещё и падает.

ручками графы строить, подбирая в нём нужные углы рёбер и размеры вершин, чтобы правильно в страницу влезал

Как вариант.

Круто. Спасибо, буду пробовать.

Я использую Dia