Не подключается Bluetooth мышь

И починить на винде ты хочешь?

«…где также установлена винда» - всегда начинать с «выключить виндовс».

при запуске системы с жёсткого диска, где также установлена винда, мышь просто не отображается в настройках

Ок. А Ubuntu тут при чём?

Проблему стоит искать в разнице настроек и логов системы где не работает и системы где работает. Винда тут определённо ни при чём. Но где и как настраивается блютуз я не интересовался никогда.

Но где и как настраивается блютуз я не интересовался никогда.

А что там настраивать? В settings/bluetooth смотришь список доступных (видимых) устройств, если нужный девайс при включении не отображается в списке, то зажимаешь на нём кнопку connect и ждёшь пока устройтво (в моём случае это наушники и xbox-ый геймпад) отобразится в списке видимых/доступных для подключения. Тыкаешь мышкой connect и всё. При следующих включениях мышка/клава/наушники и т.п. девайсы будут подключаться автоматически без каких либо действий со стороны юзверя.

если мышь обнаружена как блютус-устройство, но не распознается как мышь, то проверь, загружен ли модуль ядра uhid.

modprobe uhid в случае чего

У меня нет никаких settings. Я имел ввиду в каких конфиг файлах настройки хранятся и какими ядерными модулями всё это обслуживается.

Возможно, дело в том, что каждое спаривание двух устройств, даже одних и тех же, в разных системах — это два разных спаривания. Если мышь поддерживает несколько хост-адаптеров блютус, посмотрите в сторону спарить её еще раз в винде, переключив на блютус-2 (если блютус-1 это убунту).