Не понимаю. Вам нужна именно клавиша Scroll_Lock или ее индикатор? Если клавиша, то почему возникают проблемы? В иксах вроде нет биндингов на эту клавишу никаких.
В указанной мной команде заменять add на remove бессмысленно. Эта команда именно восстанавливает естественное поведение клавиши Scroll_Lock (связывает ее с индикатором).
В том то и дело, что что то в Xorg недаёт управлять USB KVM. Находил форум где в исходниках чел полностью выпилил функцию управления этой клавишей и только тогда USB KVM заработал.
В винде то работает без проблем и из консоли в linux.
Что-то, что-то... А если выполнить в консоли такую команду:
xset +led 3
Число придется подбирать, чтобы загорался именно индикатор scroll lock.
Это позволит проверить теорию, что вам на самом деле нужно. Клавиша или индикатор. Если все же окажется, что клавиша, предложу другое возможное решение проблемы через xmodmap.