как сделать миграцию в sqlite?

А не проще это сделать через утилиту sqlite3 ? Например, командой .read File

Лучше сделать через стандартную консоль «sqlite3». Открыть консоль и в ней дать команду «.read File» Или «cat db.sql | sqlite3».

После этих правильных операций в текущем каталоге должен появится файл с БД SQLite.