А где находится настройка «set default application»?

MIME

~/.local/share/mime

~/.config/mimeapps.list

https://wiki.archlinux.org/title/XDG_MIME_Applications#mimeapps.list

Если в названии типа файла нет его расширения, то сначала надо найти названия типа:

$ xdg-mime query filetype file.vob
video/mpeg

~/.local/share/applications/mimeapps.list если старый дистр

и проверь какой mime у твоего файла точно ли video/x-ms-vob? может и mpeg быть

xdg-mime query filetype твой_файл.vob

~/.config/mimeapps.list

Как и весь этот уродливый XDG, половина приложений использует этот файл, половина нет. Используют они его тоже по-разному.

А, да, ещё есть /usr/share/applications/mimeinfo.cache и это кеш.

Когда-то, что бы не задаваться вопросом, куда подевался новый/измененный файл и где его искать, пользовался метками и find (скрипт). Правда не для всего корня, а достаточно небольшой директории:

touch метка1
делаем изменения в системе
touch метка2

find / -newer метка1 ! -newer метка2 > log