История изменений
Исправление lucentcode, (текущая версия) :
В Debian 9 по умолчанию из коробки юзается CFQ, с ним ionice должен работать как требуется, если с ним проблемы и возникают, то из-за особенностей некоторых ФС, упомянутых 
KRoN73.
Но на всякий случай, если вы не уверены насчёт того, какой планировщик у вас юзается, можете проверить, у меня к примеру так
cat /sys/block/sda/queue/scheduler
noop deadline cfq [bfq-sq]
Используемый, это тот что в квадратных скобках.
Исходная версия lucentcode, :
В Debian 9 по умолчанию из коробки юзается CFQ, с ним ionice должен работать как требуется, если с ним проблемы и возникают, то из-за особенностей некоторых ФС, упомянутых KRoN73.
Но на всякий случай, если вы не уверены насчёт того, какой планировщик у вас юзается, можете проверить, у меня к примеру так
cat /sys/block/sda/queue/scheduler
noop deadline cfq [bfq-sq]