в my.cnf огромное количество настроек буферов и кешей, которые влияют на потребление мозгов. но я не вижу чтобы на твоей картине мускуль аж так уж много поедал. у тебя большая часть мозгов свободна вообще, и LA нулевые. не парься.
openvz учитывает не RSS а VSS, поэтому тут мускул «жрёт» 200метров. В сети можно найти кучу примеров как уменьшить VSS мускля настройками. Народ даже трэдам стэк подрезал.