При каждой линковке немного меняется бинарный файл. Похоже gcc туа записывает дату компиляции. Если возможность как-то это запретить?
Comparing files dbc_processor.exe and DBC_PROCESSOR.EXE~
00000088: 80 C3
00000089: EA DF
000000D8: BF 02
000000D9: EC E2