Исправление Radjah, 06.09.16 18:21 (текущая версия) :
Попробуй вместо chroot юзать контейнеры. systemd с ними лучше дружить должно.
Исходная версия Radjah, 06.09.16 18:20:
Изучай systemd-nspawn, там всё сразу работает.