История изменений

Или есть способы избавиться от дальнейших потерь, используя кодек с потерями?

Я так понял, идея deep-purple в том, чтобы твои файлы перегнать в технические wav, проанализировать их sox'ом и записать временные метки в условный текстовик (ну или сделать конвейер в командной строке).
А потом найденные sox'ом метки скормить тому же ffmpeg вместе с исходными файлами в формате m4a и опцией -acodec copy (как в твоём исходном посте). Соответственно, в итоговых файлах никакой перекодировки уже не будет.
Весьма разумно, кстати.
Так что я не очень понял, какие потери ты хочешь оптимизировать. Или ты имеешь в виду потери при кодировании в wav?)

Или есть способы избавиться от дальнейших потерь, используя кодек с потерями?

Я так понял, идея deep-purple в том, чтобы твои файлы перегнать в технические wav, проанализировать их sox'ом и записать временные метки в условный текстовик (ну или сделать конвейер в командной строке).
А потом найденные sox'ом метки скормить тому же ffmpeg вместе с исходными файлами в формате m4a и опцией -acodec copy (как в твоём исходном посте). Соответственно, в итоговых файлах никакой перекодировки уже не будет.
Весьма разумно, кстати.