История изменений

Ещё раз, пересоберёшь ты все 100500 пакетов по зависимостям

Да при чём тут зависимости ?? Как же тебе объяснить... Вот:
https://packages.altlinux.org/en/Sisyphus/srpms/systemd

Смотри «List of rpms provided by this srpm». Все эти подпакеты собираются из одного srpm. Допустим, я мантейнер пакета (совпадение инициалов мантейнера и мего ника, кстати, случайное :-), Алексей, кажется, тут вообще не бывает), и обнаруживаю, что надо немедленно пропатчить udev. Я его патчу. Чтобы отправить изменённый пакет в репозиторий, мне надо увеличить релиз пакета (changelog дописать и т.п.), после чего я отправляю его на сборку в репозиторий (заметь - srpm). Так вот. Релиз обновится у всего «List of rpms provided by this srpm». Так понятно ? Далее, пользователь делает apt-get update && apt-get dist-upgrade, и к нему летят все пакеты (из тех, что установлены, конечно). Хотя обновить требовалось только udev.

Ещё раз, пересоберёшь ты все 100500 пакетов по зависимостям

Да при чём тут зависимости ?? Как же тебе объяснить... Вот:
https://packages.altlinux.org/en/Sisyphus/srpms/systemd

Смотри «List of rpms provided by this srpm». Все эти подпакеты собираются из одного srpm. Допустим, я мантейнер пакета, и обнаруживаю, что надо немедленно пропатчить udev. Я его патчу. Чтобы отправить изменённый пакет в репозиторий, мне надо увеличить релиз пакета (changelog дописать и т.п.), после чего я отправляю его на сборку в репозиторий (заметь - srpm). Так вот. Релиз обновится у всего «List of rpms provided by this srpm». Так понятно ? Далее, пользователь делает apt-get update && apt-get dist-upgrade, и к нему летят все пакеты (из тех, что установлены, конечно). Хотя обновить требовалось только udev.