Решил тут на виртуалке покопать DWM. Прикрутил панельку из Conky и с этого времени ПК стал выключаться-перезагружаться больше минуты. Если выкинуть из .xsession конфиг Conky, то все мгновенно выключается и перезагружается. Видел у многих аналогичные конфиги, не пойму, почему у меня эта проблема возникла. Ставил DWM совместно к Xubuntu 15.10, если это имеет значение.