Сказать что я мучался с этой проблемой это ничего не сказать...
Ковырял разные шрифты, fonts.conf, гуглил различные мануалы ит.д.
Всем камрадам с подобной проблемой посвящается решение:

выключаем хинтинг и antialiasing в /etc/fonts/conf.available , и убиваем /usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so и все .so в папке /usr/lib/xorg/modules Перезагружаемся, работаем в любимой ОС хоть по 24 часа в сутки, проверенно 100% именно так я сейчас и работаю.

Источник тут: http://bessonov.in.ua/?page_id=629

После чего я рекомендую поставить шрифты от оффпега, и включить их поддержку в браузере. В самом дистрибутиве можно больше ничего не трогать.
Далее перезапуск.

Теперь собственно вопрос: почему именно от хинтинга и antialiasing болят глаза в разных дистрибутивах и на разных мониторах? Что именно умудрились сломать? Да, зрение минус полтора. Проверял на последних Ubuntu, Mint, Debian.