В GNOME ввели уже давно какую-то наркоманскую хрень. Если в приложении выбрать «открыть файл», pop-up окно отрывается где-то на заднем плане, а на переднем появляется уведомление, что типа окно готово. Где настроить, чтобы по-человечески диалог показывался сразу после его открытия?