Имеется стандартная установка Дебиан 9.
Вывод lsblk:
sda 8:0 0 931,5G 0 disk
├─sda1 8:1 0 512M 0 part /boot/efi
├─sda2 8:2 0 244M 0 part /boot
└─sda3 8:3 0 930,8G 0 part
└─sda3_crypt 254:0 0 930,8G 0 crypt
├─srv--vg-root 254:1 0 926,9G 0 lvm /
└─srv--vg-swap_1 254:2 0 3,9G 0 lvm [SWAP]

1. Контрольные суммы отдельных файлов, находящихся на sda2 и sda1 после перезагрузки не меняются.
2. Время последней модификации файлов, находящихся на разделах sda2 и sda1, после перезагрузки не меняется.

Но при этом, проверка контрольной суммы(md5sum), раздела sda2, после каждой перезагрузки показывает разные значения.

Проверил диффом, понятнее не стало:
5,6c5,6
< 0000420 2000 0000 2000 0000 07e0 0000 9614 5b4f
< 0000430 9614 5b4f 0018 ffff ef53 0000 0001 0000
---

0000420 2000 0000 2000 0000 07e0 0000 7efe 5b50

0000430 7efe 5b50 0019 ffff ef53 0000 0001 0000

22c22
< 0000570 0004 0000 0000 0000 2d57 0004 0000 0000
---

0000570 0004 0000 0000 0000 2d59 0004 0000 0000

Получается, что перезаписываются байты не связанные ни с одним из файлов.

Поясните, пожалуйста, что происходит?
Ну, или дайте наводку, что можно почитать?

С уважением Виктор.