Версии динамических библиотек

Программа не может не зависеть от версии библиотек.
У библиотек с разным номеров версии разный ABI (Application Binary Interface).
Когда программа линкуется, то она линкуется с конкретным ABI, т.е. с конкретной версией динамической библотеки.
Если подсунуть программе другую версию библиотеки (не ту с которой она слинкована), то дело скорее всего закончится тем, что во время загрузки исполняемого модуля программы в память не будут найдены некоторые символы, а если и будут найдены, то скорее всего будет core dumped.

Согласен, но не до конца. GTK приложение, написанное для GTK 2.x должно работать (и работает) везде (проверено установкой symlink'ов). Но при сборке мое приложение привязывается к libiconv.so.3 (точно не помню) и при переносе на другую версию FreeBSD не работает, хотя функций из libiconv не использует вообще (ее использует GTK). Соответственно даже при использовании GTK одной версии у меня не запускается приложение в FreeBSD той же версии с другой версией iconv.

В Windows работает с GTK-2.6, GTK-2.8, ...