hidden(?) partition

Опцию noauto в fstab. Или речь про флэшку или типа того?

да, про переносной жд. fstab не катит, мне нужно что бы решение не зависело от компьютера.

Можно поставить флаг hidden на партицию, это не оно?

опс.. на ext2 этот флаг не поставить, обломс

а на какую фс возможно? мне главное, что бы она права сохроняла.

ntfs

hidden - это 0x80 маска на байтовое поле в mbr.