TL;DR: fedora, nvidia, secure boot.
В подробностях: с обновой ядра модули nvidia пересобираются, следовательно ключи стираются, модули не загружаются. Я пробовал эти инструкции, но похоже, что они не дали нужный результат - после перезагрузки модули не загружаются, но не знаю как задебажить это дело.