man mkisofs.
Наводящая информация -- ключик -b <загрузочный образ>.
Пример (не стОит его тупо повторять, не поняв, что к чему):
$ ls -l | grep OpenBSD
drwxr-xr-x 4 tony users 4096 Jun 19 17:13 OpenBSD/
$ ls -l OpenBSD
drwxr-xr-x 2 tony users 4096 May 14 15:23 3.3/
mkisofs -v -T -r -J -f -b 3.3/i386/cdrom33.fs -c 3.3/i386/open.catalog -log-file 33.log -o 33.iso OpenBSD
А, кажется, понял, вам LiveCD надо сделать? Тогда с ходу не подскажу, но то ли здесь, то ли на http://www.opennet.ru была хаутушка (и там, и тут есть поиск).