В то время, как в Fedora flathub добавляют по умолчанию в дефолтную установку flatpak, Ubuntu пошла обратным путём. В дефолтной установке 23.04 не будет flatpak-а вообще. Только snap! И в других flavor-ах тоже (Kubuntu, Xubuntu, UbuntuMATE и т.д.). Если хочешь flatpak, его придется устанавливать самому.
Объясняется это как обычно заботой о пользователе: «мы послушали, как сильно вы не любите snap, и решили засадить его вам ещё глубже». Это какой-то звиздец.
От себя скажу, что я бы использовал deb-get, который устанавливает пакеты из реп производителей, а не из снапа.