После установки PCI-E USB-контроллера компьютер под управлением Fedora 18 стал просыпаться через секунду после саспенда. Заглянув в /proc/acpi/wakeup, обнаружил:
....
PXSX S4 *disabled
PXSX S4 *enabled pci:0000:03:00.0
....Команда
# echo PXSX > /proc/acpi/wakeup