Напомните, как указать нжынксу подчищать за собой дерьмо при рестарте? В текущем состоянии сокеты остаются болтаться навечно, и рестартануть он не может. Владелец файла при этом root:root.
В том же fpm есть опции, позволяющие задать владельца файла сокета. Напомните, есть ли оно в сабже.