В который раз, избитая тема.
Кто чем и __главное что__ мониторит.
Сейчас у меня zabbix + python(zabbix_api) довольно много веба и кастомных проверок для бизнеса.
Zabbix не нравится ручной настройкой и довольно большим количеством false срабатываний(или просто руки кривые)
Не пробовал, но интересно:
http://newrelic.com/
http://okmeter.io/