Вот, столкнулся с нежданчиком. Несмотря на то, что в документации прямым текстом написано:
User parameters are commands executed by Zabbix agent. Up to 512KB of data can be returned.
(zabbix версия 3.0)
реально в элемент данных помещается не более 64КБ, остальное обрезается без уведомления. Исследование показало, что для хранения в базе данных MySql использовано поле типа TEXT, которое как раз и ограничено размером 64КБ, и, хотя его легко изменить вручную на более вместительный тип данных, всё равно больше 64КБ в него не записывается. Агент при тестировании через zabbix_agentd -t <key> возвращает полное значение, значит проблема на стороне сервера, или где-то в коммуникации между ними.
Решения, собственно, никакого не жду, просто наблюдение.