Устанавливая Fedora 23 Server, подумал, что мне нужны только стабильные версии пакетов и в установщике anaconda выбрал «не устанавливать обновления пакетов». Потом после установки отключил репозиторий updates. Позже при установке пакетов получал ошибки о том, что требуется пакет из updates другой версии, а updates у меня нет. После чего понял, что updates всё же нужен и обратно включил его.
Но стали возникать ошибки при попытке что-нибудь найти в репозитории и что-нибудь установить. Решил удалить и заново загрузить кэш командами:
sudo dnf clean all
sudo dnf check-update