dns-zone сильная нагрузка

закрой входящие соединения.

Запретить рекурсию извне.

копать в сторону логов и изучать странности. Если много запросов извне на обычный resolv других доменов - то ограничивай только внутренней сеткой. Если виновник внутренняя сетка, то ищи вирусы.

не пойму, процесс dns-zone это днс сервер? тогда почему нету файла /etc/named.conf

Если вы не в курсе что это такое, могу только предположить, вас сломали. Вообще надо быть в курсе, что за процессы у вас запускаются, а не задавать вопросы на ЛОРе «у меня неизвестный мне процесс».