Вот бы iotop только чтоб не только процессы, но и файлы

strace/inotify

ну и gcc, да

inotifywatch

auditd

Вместо того, чтобы переносить часто используемые файлы, перенеси все, кроме того, что не влезает :)

тоже без костылей на сабж не тянет. Хотелось бы чтоб просто 5 колонок:
iops, Byte/s, /path/to/file/name, process_name, process_id

Это нетривиальная задача, которая, однако, отлично подходит для того, чтобы погрузиться в Linux tracing.

Почитайте про systemtap (https://sourceware.org/systemtap/). Вот готовый скрипт для того, чтобы сделать то, что вам нужно: https://sourceware.org/systemtap/SystemTap_Beginners_Guide/iotimesect.html

sysdig
отслеживание запрос (комментарий)

Спасибо, не знал про такую.

Поставил пререквизиты, stap-prep говорит 0, а скрипт потом так