Proftpd убрать доступ из браузера ftp://

Никак не сказывается, браузер такой же клиент, как любой другой.

В FTP нет юзерагента, сервер не сможет отличить браузер от небраузера. Ищи другой способ решения своей задачи.

Отключите Passive Mode оставьте только 20 и 21 порт. И тоже самое сделайте в iptables или в том фильтре что используете. Браузеры не используют активный режим.

При помощи правил iptables. Но постановка задачи какаято странная.

В фтп безопасности нет, а ты страдаешь фигнёй.

И для ftp это фича, а не баг.

Это наивная дурость древних погромиздов. Раз задокументировано — значит фича.

Вопрос уже написан в оглавлении, не могу найти информации о том, как запретить доступ по фтп из браузера

Выключи в браузере доступ по фтп

Еще, прокомментируйте пожалуйста, как это сказывается на безопасности, если есть доступ через браузер

На безопасности фтп-сервера - никак. На безопасности пользователей браузера - возможно, в зависимости от конкретных обстоятельств