Приветствую!
Проблема смешная, но при установке Webmin через .deb пакет, он смотрит на 10000 порт (дефолтный для Webmin), и если он занят, то установщик прерывает установку. К сожалению освободить порт даже на время установки не могу - в продакшене всё полетит к чертям.
Что делать? А поставить его нужно.