скопировать linux в виртуальную машину

Начни с правки /etc/fstab и восстановления grub.
С любого livecd можно сделать в chroot

спасибо, а вот эти папки которые я пропустил они сами заведутся? щас чрутом тогда размажу груб и уид дисков вмочу, интересует именно папки которыя я пропустил система сама все подсосет?

Необходимо скопировать его и завести уже на виртуалке

Нет, необходимо сделать инструкцию/плейбук/скрипт/whatever для развёртывания нужного тебе от этого хоста, чтобы ни сейчас, ни впредь такой фигнёй не страдать.

Запутался, так как не пойму что мне нужно сделать, чтобы собрать систему по косточкам до рабочего состояния

Какой инструкции ты следовал и на каком конкретном шаге застрял?

папки которыя я пропустил система сама все подсосет?

/dev,/tmp,/mnt,/media - нет.

у меня скопированные данные рсинком на примонтированном диске, не пойму как завести дальше систему, про граб и фстаб понятно все, не понятно заведется ли после этого ну или что для этого еще надо сделать

Нет, конечно, соответствующие каталоги надо сначала создать. Потом да, система смонтирует туда виртуальные файловые системы.

для того чтобы понимать нужно ли перносиить /tmp посмотри выхлоп mount на системе. он может быть смонтирован и как tmpfs и как раздел на носителе с корнем.
не забудь создать все папки в корне раздела.
ну и смотри логи ошибок.

кстати на виртуалке не забудь прописать загрузчик груба в носитель. гуглить «восстановление загрузчика груб». без загрузчика ничего не загрузится.

В списке не только виртуальные.

Всем спасибо, прописал граб, сверил фстаб, создал папки и все пока работает, понаблюдаю. Еще раз спасибо!