В чем разница между known_hosts и known_hosts.old?

Ты серьёзно или притворяешься?

known_hosts это список ключей, которые ты одобрил для указанных там же серверов

known_hosts.old то какой-нить бекап или подобное (ssh такой файл сам не создаёт), бесполезный для работы файл

Ты серьёзно или притворяешься?

Это не самый странный вопрос ТСа. Не притворяется.

Это он ещё не видел known_hosts.new и known_hosts.backup :)

known_hosts.old то какой-нить бекап или подобное

С таким ответом на пересдачу сразу.

When a key is removed, it will then be appended to the file ~/.ssh/known_hosts.old in case it is needed later. If a non-default file is used with either -F or -R then the name including the path must be specified using -f. But -f is optional if the default file is intended.

Вот только man ssh-keygen говорит:

-H      Hash a known_hosts file.  This replaces all hostnames and addresses with hashed representations within the specified file; the original content is moved to a file with a .old suffix.

Так что полный бекап файла это одно из применений.

Вот и иди.