Попробовал из PHP, установленного как модуль Apache, через system вызвать бинарный файл, c установленным SUID-битом, который создает дирректорию. Дирректория создалась от пользователя Apache. В то же время вручную от другого пользователя запустил этот же файл, дирректория создалась от того пользователя, от которого и должна была, то есть от владельца бинарного файла.
Как из PHP запустить файл под другим пользователем? (SUDO, SU отключены)