Необходимо иметь единый центр управления, который мог бы менять конфиги (того что бекапить, и как) на удаленных сервера. Возможность пересылки бекапов между серверами.
Написание своих скриптов не предлагать, так как все есть. Но это очень не удобно, каждый день то что надо бекапить меняется. Количество серверов растет, в данный момент их 14. В общем нужен комплексный продукт, желательно бесплатный, но если нет альтернатив то можно и купить.