Как устанавливать программы через configure, make..., чтобы потом удобнее их удалять?

если дистр Debian, то можно собрать пакет:
$dh_make
$dch -i
$dpkg-buildpackage -rfakeroot

если rpm-based, то тут надо можно spec написать, но это
будет на порядок сложнее

и вообще пакеты ручной сборки надо класть в /usr/local
что они с системными не смешивались

Проще всего на этапе конфигурации указывать директорию инсталляции, т.е. configure --prefix=/имя директории Тогда вся программа устанавливается туда, куда ты ей укажешь

Система именно rpm-based: Red Hat. rpmbuild пробовал один раз, но rpm не собрался. Спасибо за советы.

ну так чтоб он собрался должен быть spec файл

А checkinstall пользовать? Это и пакеты делает, и спеки писать не нужно. В простых случаях.

Попытайтесь ознакомиться с этим, как делается в Slackware. Пакет pkgtool. Позволяет собирать (makepkg), устанавливать (installpkg,upgradepkg) и удалять (removepkg).

./configure --prefix=/usr/local/бла-бла-бла make А после make: find /* > /tmp/бла-бла-бла1 make install После этого: find /* > /tmp/бла-бла-бла2 diff /tmp/бла-бла-бла1 /tmp/бла-бла-бла2 > /tmp/бла-бла-бла В файле создонном diff как раз и будет все то что установил (не обращай внимание на изменения в /proc, естественно).

make uninstall

попробуй http://relink.sourceforge.net/