Lihthttpd, может ли он ограничивать скорость на каталоги?

нет. скорее просто специфика протокола/провайдера/клиента. ограничивать скорость именно _на каталоги_ афаир ни один фтп-демон не умеет.

>> ограничивать скорость именно _на каталоги_ афаир ни один фтп-демон не умеет.

proftpd умеет.

а причем тут фтп?

iptables match string + очереди из tc

http://redmine.lighttpd.net/wiki/1/Docs:TrafficShaping
Selective traffic shaping plugin(>=1.5-svn)¶

There is a small plugin to use selective traffic shaping on a per-connection base. You can e.g. use php and do:

<?php
header("X-LIGHTTPD-KBytes-per-second: 50");
header("X-Sendfile: /path/to/file");
?>

to set the speed of the current connection.