Какую IDE нужно использовать, чтобы она подсвечивала синтаксис командных файлов различных шеллов (особенно bash),

От vim до eclipse с плагинами.

а так же синтаксис init-файлов в gentoo (которые выполняются по-моему при помощи программы /sbin/runscript)

По сути - это обычные шелл-скрипты, так же как и ebuild'ы.

От IDE нужно, чтобы она позволяла переходить от команд скрипта к справке, в которой эти команды описаны (и к примерам использования).

Предлагаю скинуться всем ЛОРом и купить автору темы хорошую губозакатывательную машинку.

Vim.

Вр.и.о. К.О.

Quote:

Предлагаю скинуться всем ЛОРом и купить автору темы хорошую губозакатывательную машинку.

Вспомнилось: «Может, вам машинку дать, чтобы губы закатать?» :-)

vim