В общем случае?
1. Никакой
2. Никакой

При чём здесь Gentoo?

Почему в заголовке стоит метка «gentoo»?

Удалённо такие вещи можно делать посредством [IP-]KVM либо remote hands.

нет таких волшебных команд

теоретически при наличии точно такой же материнки можно сравнить состояния eeprom с разными вариантами загрузки и затем сравнить с eeprom на нужном компе

не проще ли на все диски поставить загрузчики и настроить их таким образом, чтобы в любом случае управление передалось на тот диск, который нужно

дампите память по адресам где записан CMOS, hex редактор, re-flash
задача далеко не тривиальна, удачи

В общем случае?

хотя бы в частном:

# lshw

...
*-core
       description: Motherboard
       product: P5Q Premium
       vendor: ASUSTeK Computer INC.
       physical id: 0
       version: Rev 1.xx
       slot: To Be Filled By O.E.M.
     *-firmware
          description: BIOS
          vendor: American Megatrends Inc.
          physical id: 0
          version: 1306 (08/20/2008)
          size: 64KiB
          capacity: 1984KiB
          capabilities: isa pci pnp apm upgrade shadowing escd cdboot bootselect socketedrom edd int13floppy1200 int13floppy720 int13floppy2880 int5printscreen int9keyboard int14serial int17printer int10video acpi usb ls120boot zipboot biosbootspecification

такие вещи можно делать посредством

посредство не автоматизируется скриптованием

Автоматизируется вполне.

посредство не автоматизируется скриптованием

Почему же? remote hands вполне скриптуются, только они сами по себе порой кривоваты.

вообще эти вещи хорошо стандартизированы в ЦМОСе - http://www.philipstorr.id.au/pcbook/book5/cmoslist.htm
считал (/dev/nvram), изменил, подсчитал новые чексуммы (а то будет «CMOS checksum error»), залил... я бы не стал заморачиваться даже...