Xubuntu 14.04, несмотря на последние потуги, работа с внешним/вторым монитором далека от совершенства. Более всего напрягает отсутствие распознавания ранее подключенного монитора. Я бы задавал нужные параметры через xrandr скриптом, но я даже не знаю на что скрипт вешать.
Еще неприятно, что нельзя указать какой монитор является главным, а какой второстепенным. Вкупе с первой проблемой панели будут постоянно сползать.