Колесо мыши в XFree 4.2

Section "InputDevice"
	Identifier  "Mouse0"
	Driver      "mouse"
	Option	    "Protocol" "auto"
	Option	    "Device" "/dev/mouse"
	Option      "ZAxisMapping" "4 5"
EndSection

Вместо auto попробуй явно написать
ImPS/2 для PS/2
Intellimouse для COM

Попробую, спасибо!
Завтра в этой же теме напишу результат!