Не знаю как в Fedora, но...

... Параметры -> Клавиатура -> Комбинации клавиш -> Клавиша-модификатор переключает источник...
не, не то?

Главное меню Settings -> Keyboard -> Typing -> Modifiers-only...source вставить нужное

setxkbmap.

Как всегда не в тему.

В тему.

Ухты работает. Они издеваются?

Какое отношение иксовая переключалка имеет к гномовской?

Не вижу в этом ничего издевательского.

Ты попробуй что-ли. Переключалка в иксах одна и настройка комбинации переключения раскладок выполняется либо через графическую утилиту в DE, либо в xorg.conf, либо через setxkbmap.

Если вяленд - то никак
А если иксы - то по дефолту
У меня проблема была, гном падал в X11 режиме, так я переставил Fedora 22 с Server-диска, указав в пакетах Fedora Workstation (netinst образ, пакеты новые из реп берет, а не с диска) и все решилось!

попробуй еще с localectl поиграться

прямое.

Вы летите столе, индикатор работать в этом случае не будет.

Я лечу столе, работать буду. Но не индикатор.

hint: dconf -> org.gnome.desktop.input-sources -> xkb-options