Даю команду: fmpeg -c copy -i ./input.mkv -ss 00:26:54 -t 0:5:00 /tmp/output.mkv
и получаю:
ffmpeg version 2.7.1 Copyright (c) 2000-2015 the FFmpeg developers
built with gcc 4.9.3 (Gentoo 4.9.3 p1.0, pie-0.6.2)
configuration: --prefix=/usr --libdir=/usr/lib64 --shlibdir=/usr/lib64 --mandir=/usr/share/man --enable-shared --cc=x86_64-pc-linux-gnu-gcc --cxx=x86_64-pc-linux-gnu-g++ --ar=x86_64-pc-linux-gnu-ar --optflags=' ' --enable-static --enable-avfilter --enable-avresample --disable-stripping --disable-indev=oss --disable-indev=jack --disable-outdev=oss --enable-bzlib --disable-runtime-cpudetect --disable-debug --disable-doc --disable-gnutls --enable-gpl --enable-hardcoded-tables --enable-iconv --disable-lzma --enable-network --disable-openssl --enable-postproc --disable-libsmbclient --enable-ffplay --enable-vaapi --enable-vdpau --enable-xlib --disable-libxcb --disable-libxcb-shm --disable-libxcb-xfixes --enable-zlib --disable-libcdio --disable-libiec61883 --disable-libdc1394 --disable-libcaca --disable-openal --enable-opengl --disable-libv4l2 --enable-libpulse --disable-libopencore-amrwb --disable-libopencore-amrnb --disable-libfdk-aac --enable-libopenjpeg --disable-libbluray --disable-libcelt --disable-libgme --disable-libgsm --disable-libmodplug --disable-libopus --disable-libquvi --disable-librtmp --disable-libssh --disable-libschroedinger --disable-libspeex --disable-libvorbis --disable-libvpx --disable-libzvbi --disable-libbs2b --disable-libflite --disable-frei0r --disable-libfribidi --disable-fontconfig --disable-ladspa --disable-libass --disable-libfreetype --disable-libsoxr --enable-pthreads --disable-libvo-aacenc --disable-libvo-amrwbenc --enable-libmp3lame --disable-libaacplus --disable-libfaac --enable-libtheora --disable-libtwolame --disable-libwavpack --disable-libwebp --enable-libx264 --disable-libx265 --enable-libxvid --enable-x11grab --disable-avx --disable-avx2 --disable-fma3 --disable-fma4 --disable-ssse3 --disable-sse4 --disable-sse42 --disable-xop --cpu=host
libavutil 54. 27.100 / 54. 27.100
libavcodec 56. 41.100 / 56. 41.100
libavformat 56. 36.100 / 56. 36.100
libavdevice 56. 4.100 / 56. 4.100
libavfilter 5. 16.101 / 5. 16.101
libavresample 2. 1. 0 / 2. 1. 0
libswscale 3. 1.101 / 3. 1.101
libswresample 1. 2.100 / 1. 2.100
libpostproc 53. 3.100 / 53. 3.100
Unknown decoder 'copy'
В man вроде про -codecs copy упомянуто. Да и собственно с commandlinefu взял.