У меня стоит lightdm для greeter'а. Вверху есть выбор среды. В конфиге я выставил session-wrapper=lxsession При любом варианте, хоть MATE выбирай, хоть xfce, он все равно заходит в lxde. Я попытался найти, что надо в конфигах прописать, или какую-нибудь избыточную документацию, но, видимо, мои навыки гуглинга не самые лучшие.
lightdm 1.16.7 Debian stretch (был jessie)