Такая проблема: глючат чекбоксы в GTK, а именно при наведении мышки на чекбокс, "галочка" пропадает, уведёшь мышку --- появляется снова.
Причём глюк это не во всех темах, например в Clearlooks глюк есть, в Glider глюка нет.
Раньше этого глюка сто пудов не было, а что-то вдруг появился.
x11-libs/gtk+-2.8.13
x11-themes/gtk-engines-2.6.7
x11-themes/gnome-themes-2.12.3
Может в gtkrc надо чего подправить?