Этот способ не работает http://abhizweblog.blogspot.com/2011/06/gnome3-change-icon-size.html
Есть только такой файл
root@home:/usr/share/gnome-shell/theme# /usr/share/gnome-shell/theme/gnome-classic.css
/* App Vault/Grid */
.icon-grid {
spacing: 20px;
-shell-grid-horizontal-item-size: 64px;
-shell-grid-vertical-item-size: 64px; }
.icon-grid .overview-icon {
icon-size: 16px; }
и его измения не уменьшают иконки