Piper не сохраняет настройки мыши при перезагрузке.

Тоже сегодня статейку увидел, задумался. Я не помогу, я просто в зрительном зале посижу.

Какой дистрибутив? Может гномьих пакетов каких не хватает?

Я пользовался piper и всё отлично работает для моей Logitech G102.

Конечно, нужно больше подробностей: откуда брал пакеты piper и ratbag или сам собирал, их версии, какой дистрибутив? Есть смысл посмотреть issues на их гитхабе.