После запуска
sudo apt autoremove -y
Система сошла с ума и удалила много всего, что явно не было ненужным пакетом (по умолчанию улетели все составляющие libreoffice, пакеты с иконками и шрифтами mate, и даже всякие важные штуки вроде network-manager и pulseaudio!)
Я все это становил снова, везде посъезжали шрифты и темы, но я ручками все опять же повозвращал. А из pluma пропала нумерация строк. Все остальные функции на месте, но строки просто не нумеруются. Переустановка pluma не помогла. Что за пакет мог отвечать за нумерацию строк и что вообще делать?
Upd для столкнувшихся с той же проблемой: я абсолютно без понятия, в чем тут дело, но мне помогла переустановка всего gtk
