Загрузка скриптов при старте системы.

дистрибутив какой?

Прошу прощения, очевидно сразу нужно было указать. Ubuntu.

прописать скрипт в /etc/rc.local

Я догадывался. Спасибо :)

открываешь /etc/rc.d/rc.local и дописываешь вызов своего fuu.sh

Система -> Параметры -> Запускаемые приложения

Не советуй плохого.

там есть скрипт, называется skeleton, посматри в нем вроде все опичано (возможно это дебиан)