Хранитель экрана Gnome 2.22.3 (Debian 5.0.4 lenny)

Да. Попробуйте:
1) Для различных скрытых каталогов, связанных с GNOME, их переименование (чтобы проверить, работает ли пустая конфигурация)
2) aptitude reinstall <имя пакета>
3) aptitude purge <имя пакета> && aptitude install <имя пакета>

Также интересно, как именно вы ставили Zimbra.

я так понял этот хранитель экрана как то встроен в GNOME и мне не удастся его как то отдельно от GNOME удалить и заново установить.
А по поводу как ставил Zimbra, скачал исходники и понеслась :-), потом удалил, типа ./install -u (только для теста)

Поправтье если я не прав.

> скачал исходники и понеслась :-)
Никогда так больше не делайте.

Если создать нового пользователя, у него скринсейвер работать будет нормально?

Виноват исправлюсь.(а как делать?)

Пробовал создать, также не работает, курсор мышки виден а окошко для ввода пароля отсутсвует :-(

Тогда делайте aptitude reinstall для всех пакетов, связанных с gnome-screensaver.

(а как делать?)

Ставить из репозитория. Если там нет, оставлять заявку в bugzilla дистрибутива. Если срочно нужно, самостоятельно собрать пакет и поставить его (checkinstall или лучше и сложнее dpkg-buildpackage).

пробовал aptitude reinstall gnome-screensaver
непомогло :-(
по поводу aptitude reinstall для всех пакетов, связанных с gnome-screensaver.
я так понял это нужно посмотреть все зависимости этой програмулины и их переинсталить???

Да, переставить зависимости gnome-screensaver.

gnome-session-properties
проверьте, чтобы там был gnome-screensaver.